Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FPGSQ05932 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FPGSQ05932 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms