Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms