Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms