Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms