Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms