Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms