Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms