Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF3P61204 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF3P61204 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF3P61204 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms