Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIRAP54198 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIRAP54198 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms