Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THOP1P52888 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THOP1P52888 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms