Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA4P51532 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms