Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms