Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF6P49848 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF6P49848 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms