Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH9A1P49189 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms