Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms