Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ME1P48163 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms