Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PREPP48147 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PREPP48147 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PREPP48147 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PREPP48147 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PREPP48147 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms