Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms