Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC26A3P40879 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1608.1 ms