Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GGCXP38435 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GGCXP38435 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GGCXP38435 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GGCXP38435 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GGCXP38435 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms