Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL9P32969 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL9P32969 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL9P32969 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL9P32969 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL9P32969 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL9P32969 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL9P32969 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms