Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA7P31268 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms