Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ECHS1P30084 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ECHS1P30084 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms