Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA4P25789 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms