Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USF1P22415 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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