Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms