Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRAP18433 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRAP18433 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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