Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms