Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms