Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRP12270 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRP12270 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRP12270 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRP12270 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRP12270 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRP12270 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRP12270 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TPRP12270 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TPRP12270 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TPRP12270 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TPRP12270 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRP12270 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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