Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms