Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT6BP04259 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms