Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf47O95873 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms