Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms