Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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