Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNMO15061 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms