Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9YO00507 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
USP9YO00507 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms