Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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