Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DGG1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DGG1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DGG1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DGG1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DGG1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms