Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CFAP73A6NFT4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CFAP73A6NFT4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CFAP73A6NFT4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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