Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms