Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms