Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLH3Q9UHC1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms