Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms