Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP2BPQ9P2M1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms