Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms