Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F12Q9HCS2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms