Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC3GQ9HC16 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms