Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450344.3-201ENST00000430770 378 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356277.3-202ENST00000436672 587 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01548-201ENST00000451980 696 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001619.2-201ENST00000458654 587 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX26-AS1-211ENST00000589840 865 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00969-278ENST00000626870 851 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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