Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms